رمان ریشه‌های شر داستان نویسنده‌ی جوانی را دنبال می‌کند که نمی‌تواند رمان دومش را بنویسد. رمان اولش بسیار موفق و محبوب بوده و اکنون او برای نوشتن رمان دومش با مشکلاتی روبه‌روست. استادش او را به شهر کوچک زادگاهش دعوت می‌کند تا شاید تغییر مکان راه‌حلی برای مشکلش باشد. این استاد یکی از مهم‌ترین رمان‌های قرن اخیر را نوشته و نویسنده‌ی جوان برایش احترام بسیاری قائل است. اما تغییر مکان دوای دردش نیست و نویسنده‌ی جوان بیش از پیش کلافه و سردرگم می‌شود. او در جست‌وجویش در خانه‌ی استاد، دست‌نوشته‌های قدیمی او را پیدا می‎کند و به رازی پی می‌برد. این راز باعث می‌شود که پس از بازداشت شدن استادش به اتهام قتل، برای اثبات بی‌گناهی او تلاش کند و رمانش را در این راه بنویسد.